La collection d'archives du Musée des Tatras débuta dès la fondation du Musée. Au début, ce furent des documents de l'Association du Musée des Tatras et ceux du Musée. A partir de 1922, quand Juliusz Zborowski commença à travailler au Musée, il se mit à rassembler d'une manière systématique des documents ethnographiques, linguistiques et historiques concernant les Tatras, le Podhale, le Spisz et l'Orava.
A présent, les archives contiennent plus de trois mille cinq cents pièces, du 17e au 20e siècle. Parmi celles-ci, il faut particulièrement mentionner des documents sur parchemin: les privilèges royaux des années 1628-1766 octroyés aux maires Dzielski, Nowobilski et Chochołowski et l'acte de noblesse (1674) accordé par l'empereur Léopold 1er à la famille Moniak de Zubrzyca Górna. Dans les archives, une place importante est occupée par des documents des organisations qui fonctionnaient à Zakopane à partir de la seconde moitié du 19e siècle, comme l'Association Polonaise des Tatras (1873-1930) et sa Section de l'Etude des Peuples (1913-1918), le Comité de la Construction du monument dédié à Tytus Chałubiński (1900-1904), l'Association de l'Ecole Populaire (1909-1932), l'Ecole de l'industrie du bois (1881-1946), l'Association pour la Protection des Monuments de la région de Podhale PTTK (1951-1980).
On y trouve aussi des documents relatifs à l'histoire de la presse de Zakopane, entre autre de Przegląd Zakopiański [Revue de Zakopane] (1899-1906), de Zakopane (1908-1914), d'Echo Tatrzańskie [Echo des Tatras] (1918-1919), de Gazeta Podhalańska [la Gazette du Podhale] (1913-1934), de Gazeta Zakopiańska [la Gazette de Zakopane] (1893) et de Zakopiańska Sp. Wydawnicza [Société d'Édition de Zakopane] (1913-1914).
Une catégorie particulière regroupe les archives des familles liées par leurs activités avec Zakopane, le Spisz et l'Orava : les Homolacs de Zakopane (1813-1909), les Machay (1930-1962), les Moniak de Zubrzyca Górna (17e et 18e siècles), les Uznański de Szaflary (1827-1939), les Wilczek et les Divéky de Podwilk (du 17e au 20e siècle), les Witkiewicz (19e et 20e siècles).
Le Podhale, et Zakopane surtout, furent pendant de longues années le terrain d'activité de nombreuses personnes, souvent éminentes, dont les champs d'activités étaient la culture, la politique et l'économie et qui contribuèrent d'une façon très importante au développement de la ville et de la région. Les archives du Musée des Tatras conservent de nombreux legs : Stanisław Barabasz (1857-1941), Wojciech Brzega (1872-1941), Jan Bednarski (1866-1926), Maria et Bronisław Dembowski (1888-1912), Józef Diehl (1882-1955), Bronisława et Kazimierz Dłuski (1900-1922), Stanisław Eljasz-Radzikowski (1869-1935), Aniela Gut-Stapińska (1898-1954), Matylda Jostowa (1882-1977), Kornel Makuszyński (1884-1953), Olga Małkowska (1888-1979), Franciszek Henryk Nowicki (1864-1935), Jan Pluciński (1897-1982), Helena Roj-Kozłowska (1900-1955), Kazimierz Saysse-Tobiczyk (1891-1980), Mariusz Zaruski (1867-1941) et Juliusz Zborowski (1913-1965), les dates entre parenthèses indiquant la période que recouvrent les archives disponibles.